RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35C1Q96A29 364 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA33Q96N06 139 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DESI2Q9BSY9 194 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP72Q9P209 647 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.35□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 EPHB6O15197 1021 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPK13O15264 365 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT13P13646 458 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMC4P43686 418 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC26A2P50443 739 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TERF1P54274 439 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKCZQ05513 592 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMC2Q13753 1193 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PDXDC1Q6P996 788 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR59Q6PJI9 974 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DPP9Q86TI2 863 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GLG1Q92896 1179 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP89Q96ST8 783 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SRRDQ9UH36 339 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.34□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GH1P01241 217 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARL2P36404 184 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 NAMPTP43490 491 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PRMT2P55345 433 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP1Q07960 439 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF22Q14807 665 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GBP6Q6ZN66 633 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RRAGAQ7L523 313 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 DEPTORQ8TB45 409 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 BAP1Q92560 729 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 COPS5Q92905 334 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNN1Q92952 543 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM143Q96AN5 459 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CHP1Q99653 195 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GANQ9H2C0 597 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.33□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC53A6NM62 1247 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TISP43B9A030 160 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 NOL4O94818 638 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA10O95299 355 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GLRA2P23416 452 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MARK3P27448 753 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FMO5P49326 533 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FCGRTP55899 365 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 BFSP1Q12934 665 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF6Q15052 776 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCB4Q15147 1175 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM50Q86XT4 487 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF18AQ8NI77 898 aa11.32□□□□□ -0.6
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