RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.51■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KCNG1Q9UIX4 513 aa28.51■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 HOXD13P35453 343 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 NAMPTP43490 491 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 DNM2P50570 870 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 HAUS6Q7Z4H7 955 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.5■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 CABYRO75952 493 aa28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 CLTBP09497 229 aa28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 GTF2BQ00403 316 aa28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ITGA7Q13683 1181 aa28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 CAPSQ13938 189 aa28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 NELFCDQ8IXH7 590 aa28.49■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 BICDL2A1A5D9 508 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TMOD1P28289 359 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KCNA1Q09470 495 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TTI2Q6NXR4 508 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TOX2Q96NM4 488 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KCTD10Q9H3F6 313 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 SPATA1Q5VX52 437 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KSR1Q8IVT5 923 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 BADQ92934 168 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KCNN1Q92952 543 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa28.48■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 LRRIQ4A6NIV6 560 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 GNAT1P11488 350 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 UVSSAQ2YD98 709 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 RHPN2Q8IUC4 686 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.47■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 H0YCG3 227 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ASAP2O43150 1006 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TREHO43280 583 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 BMP8BP34820 402 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 LRRC63Q05C16 580 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 SESTD1Q86VW0 696 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 HVCN1Q96D96 273 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 HSD3B7Q9H2F3 369 aa28.46■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 DENND3A2RUS2 1198 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 MRE11P49959 708 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 DEPTORQ8TB45 409 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 MAP7D2Q96T17 732 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 AKT3Q9Y243 479 aa28.45■■■□□ 2.15
SOBP-202ENST00000477448 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.45■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CYP2C9P11712 490 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 SCP2P22307 547 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 ABCD1P33897 745 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 RNF149Q8NC42 400 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TSG101Q99816 390 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 FANCLQ9NW38 375 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TBX20Q9UMR3 447 aa28.44■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TFDP1Q14186 410 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 ACCSQ96QU6 501 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TMEM206Q9H813 350 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 LAMA3Q16787 3333 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 PDXKO00764 312 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 KIAA0355O15063 1070 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CD4P01730 458 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 VTNP04004 478 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TAS1R3Q7RTX0 852 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms