RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	PLVAP	Q9BX97	442 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	THEG	Q9P2T0	379 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089		E9PMD0	336 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	ERLIN2	O94905	339 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	EOMES	O95936	686 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP11B2	P19099	503 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	POLD4	Q9HCU8	107 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	POU5F1B	Q06416	359 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	REST	Q13127	1097 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	HSCB	Q8IWL3	235 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	CWH43	Q9H720	699 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	MYO7A	Q13402	2215 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	TSPAN1	O60635	241 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNK18	Q7Z418	384 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	BSND	Q8WZ55	320 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	P2RX5	Q93086	422 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	CPB2	Q96IY4	423 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	DNM3	Q9UQ16	869 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	ITGB1	P05556	798 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	SKI	P12755	728 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	PLIN2	Q99541	437 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	MTMR6	Q9Y217	621 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	EYA4	O95677	639 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB27A	P51159	221 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	UBXN11	Q5T124	520 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	AAAS	Q9NRG9	546 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FBXO18-208	ENST00000470089	TFF2	Q03403	129 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	AMHR2	Q16671	573 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC43	Q8N309	656 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	PNMA5	Q96PV4	448 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CLIC4	Q9Y696	253 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	B4GALT5	O43286	388 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF623	O75123	536 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	BMP15	O95972	392 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJB1	P25685	340 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	STX6	O43752	255 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	LAG3	P18627	525 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	AXL	P30530	894 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	GRIN1	Q05586	938 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	PBX3	P40426	434 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CAMK1	Q14012	370 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	HYI	Q5T013	277 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	NOTUM	Q6P988	496 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CABP7	Q86V35	215 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	PGBD4	Q96DM1	585 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	POF1B	Q8WVV4	589 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	HLA-C	Q95604	372 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	FGF18	O76093	207 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	LIG1	P18858	919 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	NAMPT	P43490	491 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	KIFAP3	Q92845	792 aa		32.39	■■■□□ 2.78

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