RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 HMCESQ96FZ2 354 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC140Q96MF4 163 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KCNJ15Q99712 375 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ELOVL5Q9NYP7 299 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 RNF181Q9P0P0 153 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQH9 124 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 FAM221BA6H8Z2 402 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 MAFO75444 373 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 HLA-DOAP06340 250 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 NR4A2P43354 598 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KCNJ6P48051 423 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 SCAPQ12770 1279 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf159Q96HA4 380 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 Q96MF0 132 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CTAGE1Q96RT6 745 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 TEX101Q9BY14 249 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PPT2Q9UMR5 302 aa2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ARID3CA6NKF2 412 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 TOX4O94842 621 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 NAT2P11245 290 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 CKBP12277 381 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 GRK2P25098 689 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 GRK3P35626 688 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 NPEPPSP55786 919 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 GFRA1P56159 465 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 LLGL1Q15334 1064 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 KRT40Q6A162 431 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 NPNTQ6UXI9 565 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM145Q8NBT3 493 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 SLC7A14Q8TBB6 771 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 SARAFQ96BY9 339 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 GPR27Q9NS67 375 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 UCKL1Q9NWZ5 548 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 ICKQ9UPZ9 632 aa2.53□□□□□ -2
SHQ1-204ENST00000468347 MARCH11A6NNE9 402 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 LEFTY2O00292 366 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SORBS3O60504 671 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 JUNP05412 331 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 MAP3K12Q12852 859 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 FAM214AQ32MH5 1076 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 CMTM4Q8IZR5 234 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ACTRT2Q8TDY3 377 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ARMC5Q96C12 935 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 NRIP3Q9NQ35 241 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 NCDNQ9UBB6 729 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 DENND2AQ9ULE3 1009 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 MYMKA6NI61 221 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 DIRC3C9JPN6 131 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 HERVK_113P62684 666 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 RESTQ13127 1097 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 TIMP4Q99727 224 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 HEPHQ9BQS7 1158 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SMURF1Q9HCE7 757 aa2.51□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 AOX1Q06278 1338 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 GPD1P21695 349 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 CLEC14AQ86T13 490 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 NLGN4XQ8N0W4 816 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 PLA2G15Q8NCC3 412 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 VTI1BQ9UEU0 232 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 GGT7Q9UJ14 662 aa2.5□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 WT1P19544 449 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 THBS3P49746 956 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 GRM1Q13255 1194 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ERV3-1Q14264 604 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 GFI1BQ5VTD9 330 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 FCRLBQ6BAA4 426 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 VHLLQ6RSH7 139 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 NEK8Q86SG6 692 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 GPR149Q86SP6 731 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 KRT73Q86Y46 540 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 TRMOQ9BU70 441 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SPON2Q9BUD6 331 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 SRPK3Q9UPE1 567 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-204ENST00000468347 PRAMEF25A6NGN4 478 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms