RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NCKAP1LP55160 1127 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CCL23P55773 120 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PTENP60484 403 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CDC42EP1Q00587 391 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TFDP1Q14186 410 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 GPNMBQ14956 572 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PPP2R5AQ15172 486 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NFKBIBQ15653 356 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 ODR4Q5SWX8 454 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 RNF149Q8NC42 400 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SPATA20Q8TB22 786 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NLRP7Q8WX94 980 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 HPS3Q969F9 1004 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 IFT74Q96LB3 600 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NFKBIZQ9BYH8 718 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 GINS2Q9Y248 185 aa11.31□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC169A6NNP5 214 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SLC16A4O15374 487 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TRAK2O60296 914 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NBNO60934 754 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 RAG1P15918 1043 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PHKA2P46019 1235 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CLCN6P51797 869 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 MBTD1Q05BQ5 628 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 LPIN1Q14693 890 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CAMK4Q16566 473 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 DEPTORQ8TB45 409 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 DPF3Q92784 378 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KCNN1Q92952 543 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SCLYQ96I15 445 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SCLT1Q96NL6 688 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.3□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 RHOBTB3O94955 611 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SMC2O95347 1197 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 MYBP10242 640 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 GHRP10912 638 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SYN1P17600 705 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 CASP5P51878 434 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KCNB1Q14721 858 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 MFSD5Q6N075 450 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 FAM228AQ86W67 206 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 USP38Q8NB14 1042 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SMARCE1Q969G3 411 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 VWCEQ96DN2 955 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 STRA6Q9BX79 667 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 FZD8Q9H461 694 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 EXOC1Q9NV70 894 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 SQORQ9Y6N5 450 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.29□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 DENND3A2RUS2 1198 aa11.28□□□□□ -0.6
GARNL3-211ENST00000460176 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms