RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 DEFB103AP81534 67 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 AMPD3Q01432 767 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 DYMQ7RTS9 669 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 DDX12PQ92771 950 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 ADAM2Q99965 735 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 TNMDQ9H2S6 317 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 CHST12Q9NRB3 414 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 HPSEQ9Y251 543 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 MGEA5O60502 916 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 NPTX2P47972 431 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 DSC3Q14574 896 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 RGS18Q9NS28 235 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 MYCT1Q8N699 235 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 STAMQ92783 540 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 ZNF131P52739 623 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-202ENST00000440447 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTX4-202ENST00000440447 SLC16A4O15374 487 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTX4-202ENST00000440447 LIG1P18858 919 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTX4-202ENST00000440447 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTX4-202ENST00000440447 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 TRIM9Q9C026 710 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 ACKR2O00590 384 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 GJB5O95377 273 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 AFMP43652 599 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-202ENST00000440447 RABGGTBP53611 331 aa20.12■□□□□ 0.81
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