RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARMCX2Q7L311 632 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLK2Q86UE8 772 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP44Q9H0E7 712 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MARK1Q9P0L2 795 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STK17AQ9UEE5 414 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIPK3Q9Y572 518 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STXBP3O00186 592 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BNIP3LO60238 219 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GJB5O95377 273 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQCF3P0C7M6 154 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TGFB3P10600 412 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX18P35713 384 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GMPRP36959 345 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAT3P40763 770 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCD1P51178 756 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PKN1Q16512 942 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LONRF1Q17RB8 773 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KANK3Q6NY19 840 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNMA5Q96PV4 448 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COPRSQ9NQ92 184 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM50BQ9Y247 325 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRYQ5TBA9 3013 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ESYT3A0FGR9 886 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VWA5AO00534 786 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC01565O15544 149 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAIAP3O94812 1187 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSPG5O95196 566 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP3K6O95382 1288 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSAPP07602 524 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARP10275 920 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBP3P10745 1247 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFKB1P19838 968 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRM1P23921 792 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFC2P35250 354 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPEM2Q0P670 501 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HYAL2Q12891 473 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST3GAL2Q16842 350 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCF12Q99081 682 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC30A3Q99726 388 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCB6Q9NP58 842 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CABP5Q9NP86 173 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPEGQ15772 3267 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALG1L2C9J202 215 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CABYRO75952 493 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAG3O95817 575 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MX2P20592 715 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PMLP29590 882 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATICP31939 592 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PEX19P40855 299 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP2K3P46734 347 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTN2Q02246 1040 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFAIP2Q03169 654 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HYAL1Q12794 435 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TFCP2Q12800 502 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms