RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM11Q96F44 468 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5C1BQ96P26 610 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 RMDN3Q96TC7 470 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PLVAPQ9BX97 442 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS50Q9UI38 385 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP13Q9UII6 198 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.52□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 NACADO15069 1562 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PPL8 197 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 WASH4PA8MWX3 477 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ISM1B1AKI9 464 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ENM7 598 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC27A2O14975 620 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 IRAK2O43187 625 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 LTKP29376 864 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH9A1P49189 494 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 HERVK_113P62684 666 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 NUCB1Q02818 461 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ADCY2Q08462 1091 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 IL10RAQ13651 578 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC96Q2M329 555 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MPEG1Q2M385 716 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 GAB4Q2WGN9 574 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ZACNQ401N2 412 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 EMC4Q5J8M3 183 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 STEAP3Q658P3 488 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 GGT6Q6P531 493 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ZPBP2Q6X784 338 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 IL31RAQ8NI17 732 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB15Q8WXK1 588 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 KAT5Q92993 513 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MYRFLQ96LU7 910 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 GBP4Q96PP9 640 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 SERINC2Q96SA4 455 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ADI1Q9BV57 179 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMT1Q9H993 441 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB1Q9Y576 335 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.51□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MYPNQ86TC9 1320 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NCN8 305 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BM21 787 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM229AH3BQW9 127 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PLA2G6O60733 806 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 BAIAP3O94812 1187 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CD4P01730 458 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MCAMP43121 646 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 HK3P52790 923 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 GRM1Q13255 1194 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 MYBPC3Q14896 1274 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 POSTNQ15063 836 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CNGA2Q16280 664 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PFKFB4Q16877 469 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 TMC6Q7Z403 805 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 HIPK4Q8NE63 616 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 DPF2Q92785 391 aa5.5□□□□□ -1.53
CBX1P4-201ENST00000439415 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105 ms