RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	PTMS	P20962	102 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FGFR4	P22455	802 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPA1	P27694	616 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	SFN	P31947	248 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	CLCN3	P51790	818 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	EPHA7	Q15375	998 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	E2F4	Q16254	413 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	PHOX2B	Q99453	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	RAB34	Q9BZG1	259 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TLE6	Q9H808	572 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	EML1	O00423	815 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	HBP1	O60381	514 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	GAS7	O60861	476 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TXK	P42681	527 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	ME1	P48163	572 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	JAK3	P52333	1124 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	NHLH1	Q02575	133 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	P2RX5	Q93086	422 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	CLIC6	Q96NY7	704 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRIO	O75962	3097 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	POTEM	A6NI47	508 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	WDR64	B1ANS9	1081 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561		C9IYK1	514 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	NCK2	O43639	380 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	FGF18	O76093	207 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	STBD1	O95210	358 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	C22orf31	O95567	290 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	MRE11	P49959	708 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	IER5L	Q5T953	404 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	CWH43	Q9H720	699 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP25	Q9UHP3	1055 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	SAMM50	Q9Y512	469 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561		A0A087X0B3	334 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHMP2A	O43633	222 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPR32	O75388	356 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75

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