RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 DYDC2Q96IM9 177 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 CARNS1A5YM72 827 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 MARCH6O60337 910 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 JAK2O60674 1132 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 LYPLA2O95372 231 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 NEK4P51957 841 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 ST3GAL1Q11201 340 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 EMC2Q15006 297 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 SUSD6Q92537 303 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 HIDE1A8MVS5 230 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 BCAR1P56945 870 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 TCP11Q8WWU5 503 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM143Q96AN5 459 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-204ENST00000426921 BTBD18B2RXH4 712 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ASAP2O43150 1006 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 SLITRK3O94933 977 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 CYP4A11Q02928 519 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 CALCRLQ16602 461 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 FERMT3Q86UX7 667 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 RNF135Q8IUD6 432 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 LPPQ93052 612 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 WNT7AO00755 349 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB39O15060 712 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 NEMFO60524 1076 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 XKR9Q5GH70 373 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TMC7Q7Z402 723 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 S1PR5Q9H228 398 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 OFD1O75665 1012 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 SEC24BO95487 1268 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 PGBD4Q96DM1 585 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM169Q96HH4 297 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MTMR9Q96QG7 549 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MTRQ99707 1265 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TRIOO75962 3097 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 POU5F1BQ06416 359 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM29Q14134 588 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 UBXN11Q5T124 520 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TPH2Q8IWU9 490 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 RNF149Q8NC42 400 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 FAM122AQ96E09 287 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 IRAK3Q9Y616 596 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 IGSF21Q96ID5 467 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 ZBP1Q9H171 429 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 DGAT1O75907 488 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 GALTP07902 379 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 TECP42680 631 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 PTENP60484 403 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 LONRF3Q496Y0 759 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 CASP10Q92851 521 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 RSAD1Q9HA92 442 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms