RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425112.1

TTC28-AS1-205, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 LETM2Q2VYF4 491 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SYCE2Q6PIF2 218 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.52□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 XBP1P17861 261 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TECP42680 631 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PSEN1P49768 467 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RAB27AP51159 221 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BCAR1P56945 870 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ANAPC15P60006 121 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TMC7Q7Z402 723 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 C4orf19Q8IY42 314 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HAS1Q92839 578 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 IRAK3Q9Y616 596 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CTDNEP1O95476 244 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RFC5P40937 340 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NPEPPSP55786 919 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZXDAP98168 799 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EPHA7Q15375 998 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KSR1Q8IVT5 923 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 OXER1Q8TDS5 423 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CASP10Q92851 521 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TMEM169Q96HH4 297 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NLRP4Q96MN2 994 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 C5orf42Q9H799 3197 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TMEM221A6NGB7 291 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 M0R296 226 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 OFD1O75665 1012 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ITIH3Q06033 890 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GIT2Q14161 759 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ANKRD1Q15327 319 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WASF1Q92558 559 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TNFRSF25Q93038 417 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 LPPQ93052 612 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PGBD4Q96DM1 585 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 IGSF21Q96ID5 467 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CEP170P1Q96L14 293 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FBXL18Q96ME1 805 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 LXNQ9BS40 222 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZBP1Q9H171 429 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ASAP2O43150 1006 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 LYPLA2O95372 231 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CXCL14O95715 111 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms