RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM29Q14134 588 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 LZTS1Q9Y250 596 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PPME1Q9Y570 386 aa25.13■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 A0A087WWV3 80 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 NEMFO60524 1076 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 DUSP6Q16828 381 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 C8orf34Q49A92 452 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 FERMT3Q86UX7 667 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.12■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 HIDE1A8MVS5 230 aa25.11■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 EYA4O95677 639 aa25.11■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 ATP2B1P20020 1258 aa25.11■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 TCF25Q9BQ70 676 aa25.11■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 SPG21Q9NZD8 308 aa25.11■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 POTEMA6NI47 508 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 LYPLA2O95372 231 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 BCAR1P56945 870 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 COASYQ13057 564 aa25.1■■□□□ 1.61
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KDELR3-202ENST00000409006 RNF149Q8NC42 400 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 MTRQ99707 1265 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.1■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF623O75123 536 aa25.09■■□□□ 1.61
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KDELR3-202ENST00000409006 PPM1AP35813 382 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 KCNC3Q14003 757 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 UBXN11Q5T124 520 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 TCP11Q8WWU5 503 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.09■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 GPR37L1O60883 481 aa25.08■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 OFD1O75665 1012 aa25.08■■□□□ 1.61
KDELR3-202ENST00000409006 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.08■■□□□ 1.61
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KDELR3-202ENST00000409006 C8orf76Q96K31 380 aa25.08■■□□□ 1.61
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KDELR3-202ENST00000409006 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 SKIP12755 728 aa25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 RAB27AP51159 221 aa25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 KRT17Q04695 432 aa25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.07■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 RARRES1P49788 294 aa25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 TMC7Q7Z402 723 aa25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ARL2P36404 184 aa25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 PTENP60484 403 aa25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF174Q15697 407 aa25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 MED24O75448 989 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 DGAT1O75907 488 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 GALTP07902 379 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 CAPSQ13938 189 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 CPB2Q96IY4 423 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 GBP3Q9H0R5 595 aa25.04■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 DCXO43602 365 aa25.03■■□□□ 1.6
KDELR3-202ENST00000409006 TSPAN1O60635 241 aa25.03■■□□□ 1.6
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