RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.39■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.39■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 FAM187AA6NFU0 413 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EXOC3O60645 756 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 LRRN2O75325 713 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 POLR2MP0CAP2 368 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 VCAM1P19320 739 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PPARDQ03181 441 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 IFT88Q13099 833 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 MAPK7Q13164 816 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CLUL1Q15846 466 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CEP55Q53EZ4 464 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TLCD1Q96CP7 247 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 MASTLQ96GX5 879 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 FAM170AA1A519 330 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ECE2O60344 883 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ENTPD3O75355 529 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PDE6BP35913 854 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 RAPGEF5Q92565 580 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 HOOK2Q96ED9 719 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ECE1P42892 770 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 MYBPC2Q14324 1141 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 DAW1Q8N136 415 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 GLG1Q92896 1179 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PSMD1Q99460 953 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ALG6Q9Y672 507 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 HIP1RO75146 1068 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ARP10275 920 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TCEAL1Q15170 157 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 QPCTQ16769 361 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 JAMLQ86YT9 394 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 RDH13Q8NBN7 331 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.37■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 C5orf60A6NFR6 353 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CCDC174Q6PII3 467 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 LXNQ9BS40 222 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 H0YHG0 523 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TRIM37O94972 964 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 BCRP11274 1271 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 DLG4P78352 724 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CSRNP1Q96S65 589 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 VCPKMTQ9H867 229 aa20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EMSYQ7Z589 1322 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 NUDT17P0C025 328 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 KRT13P13646 458 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 DRP2Q13474 957 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 AADACL2Q6P093 401 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ACER1Q8TDN7 264 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PFASO15067 1338 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PHF2O75151 1096 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PTGIRP43119 386 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EP400Q96L91 3159 aa20.35■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CAND2O75155 1236 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SHBGP04278 402 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PMS2P54278 862 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PPP3CAQ08209 521 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PLCB4Q15147 1175 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 HOOK3Q86VS8 718 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 KRT35Q92764 455 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms