RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SIP14410 1827 aa17.02■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH15Q9Y2K3 1946 aa17.02■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 C9IYK1 514 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HIP1RO75146 1068 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFR4P22455 802 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PBX2P40425 430 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 STAT6P42226 847 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DSC3Q14574 896 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 GPBP1Q86WP2 473 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA7Q9UN72 937 aa17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0U1RQF3 1178 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA2O43364 376 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MGEA5O60502 916 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SMTNP53814 917 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM189BP81408 668 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MCM6Q14566 821 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK6Q16659 721 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SV2BQ7L1I2 683 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 IQUBQ8NA54 791 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01599Q8WXQ3 324 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC51Q96ER9 411 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAIPQ9BWF2 469 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC27Q9C0I9 530 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MINDY3Q9H8M7 445 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM161AQ9NX61 479 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC169A6NNP5 214 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YCG3 227 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 EOMESO95936 686 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB27AP51159 221 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PANK2Q9BZ23 570 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CUEDC2Q9H467 287 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF576Q9H609 170 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 K7ERI5 159 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM13AO94988 1023 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CA3P07451 260 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PLS3P13797 630 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MYOGP15173 224 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SCP2P22307 547 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PEX3P56589 373 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 AMPD3Q01432 767 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM187BQ17R55 369 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ADALQ6DHV7 355 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 NOTUMQ6P988 496 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SHC4Q6S5L8 630 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PDILTQ8N807 584 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 BSNDQ8WZ55 320 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ACKR2O00590 384 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPAN1O60635 241 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DGKIO75912 1065 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CMA1P23946 247 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCD1P33897 745 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 NPTX2P47972 431 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK7Q13164 816 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ARSHQ5FYA8 562 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RESP18Q5W5W9 173 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ABI1Q8IZP0 508 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DAW1Q8N136 415 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CNNM3Q8NE01 707 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms