RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359253.2

CCDC197-201, Transcript of coiled-coil domain containing 197, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC197, Length 1,275 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197-201ENST00000359253 ACVR2BQ13705 512 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 SYCP1Q15431 976 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 TRIB2Q92519 343 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 CEP89Q96ST8 783 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 TBX20Q9UMR3 447 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 ARID2Q68CP9 1835 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM150BA6NC51 233 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ASAP2O43150 1006 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ZSCAN12O43309 604 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 INHAP05111 366 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ELNP15502 786 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 KRT9P35527 623 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 POLD4Q9HCU8 107 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 COL1A2P08123 1366 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 SLC16A4O15374 487 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 MAGEB2O15479 319 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 MSCO60682 206 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 AKAP3O75969 853 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 GJB1P08034 283 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 GARTP22102 1010 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CDK17Q00537 523 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 KCNA1Q09470 495 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 KCNH2Q12809 1159 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CCL14Q16627 93 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CEP135Q66GS9 1140 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 USP37Q86T82 979 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM139Q8IV31 216 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 NEK11Q8NG66 645 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 BORCS6Q96GS4 357 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 DNAJC7Q99615 494 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 Q9Y3F1 56 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 TTC26A0AVF1 554 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 DENND3A2RUS2 1198 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CLIC2O15247 247 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 P4HA2O15460 535 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 SORBS3O60504 671 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 EXOC3O60645 756 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CCL5P13501 91 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 KRT13P13646 458 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 EFNA5P52803 228 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 POU5F1BQ06416 359 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 STRN3Q13033 797 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PLCB4Q15147 1175 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 RNF208Q9H0X6 261 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PMM2O15305 246 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PIGRP01833 764 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CNGA1P29973 690 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 CETN1Q12798 172 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 DGKDQ16760 1214 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC197-201ENST00000359253 GBP6Q6ZN66 633 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms