RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 BORCS6Q96GS4 357 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 STK38LQ9Y2H1 464 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLGNO14967 610 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAD21O60216 631 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF2O75151 1096 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRN2O75325 713 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT16P08779 473 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNJ1P48048 391 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CBWD6Q4V339 395 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF570Q96NI8 536 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 STK33Q9BYT3 514 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB5O15062 677 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNFAIP3P21580 790 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM49P0CI25 452 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM49CP0CI26 452 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC8A3P57103 927 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP2R5EQ16537 467 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP40Q9NVE5 1235 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE6CP51160 858 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANO3Q9BYT9 981 aa24.05■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NYXQ9GZU5 481 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 FMO5P49326 533 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 GALNTL6Q49A17 601 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERICH1Q86X53 443 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD42Q8N9B4 389 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL29Q96CT2 875 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NGLY1Q96IV0 654 aa24.04■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 MXD3Q9BW11 206 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACSL3O95573 720 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALADP13716 330 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHRNA3P32297 505 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 GDAP1Q8TB36 358 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.03■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM120BA0PK00 339 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD62A6NC57 917 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSPA1LP34931 641 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 FITM2Q8N6M3 262 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGL1Q9NZL6 768 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PFASO15067 1338 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTLL1O95922 423 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 GH1P01241 217 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPA1P27694 616 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPDL1Q96EA4 605 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD209Q9NNX6 404 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PYGMP11217 842 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 RARGP13631 454 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNAP25P60880 206 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 COPS2P61201 443 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 BNIP1Q12981 228 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms