RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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PTX3-201ENST00000295927 ADSSP30520 456 aa24.98■■□□□ 1.59
PTX3-201ENST00000295927 RGS2P41220 211 aa24.98■■□□□ 1.59
PTX3-201ENST00000295927 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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PTX3-201ENST00000295927 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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PTX3-201ENST00000295927 DEPTORQ8TB45 409 aa24.98■■□□□ 1.59
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PTX3-201ENST00000295927 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.97■■□□□ 1.59
PTX3-201ENST00000295927 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.97■■□□□ 1.59
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PTX3-201ENST00000295927 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.96■■□□□ 1.59
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PTX3-201ENST00000295927 TRIM49CP0CI26 452 aa24.94■■□□□ 1.58
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PTX3-201ENST00000295927 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.94■■□□□ 1.58
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PTX3-201ENST00000295927 ADCY3O60266 1144 aa24.93■■□□□ 1.58
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PTX3-201ENST00000295927 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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PTX3-201ENST00000295927 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX3-201ENST00000295927 RRAGAQ7L523 313 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX3-201ENST00000295927 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX3-201ENST00000295927 SAAL1Q96ER3 474 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX3-201ENST00000295927 GANQ9H2C0 597 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX3-201ENST00000295927 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.92■■□□□ 1.58
PTX3-201ENST00000295927 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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