RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275820.3

NOM1-201, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOM1, Length 6,077 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-201ENST00000275820 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.08■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 PDIA5Q14554 519 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 BRAFP15056 766 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SAAL1Q96ER3 474 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 CHUKO15111 745 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GYG2O15488 501 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 HSPA4LO95757 839 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 PODNQ7Z5L7 613 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 UBE4BO95155 1302 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ECE2O60344 883 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 EMSYQ7Z589 1322 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ATP5HO75947 161 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 KRT38O76015 456 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 STXBP2Q15833 593 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 MAPK6Q16659 721 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TC2NQ8N9U0 490 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RUBCNQ92622 972 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 AMACRQ9UHK6 382 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 PFASO15067 1338 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SLC12A1Q13621 1099 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 CYTH2Q99418 400 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SFNP31947 248 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ABI1Q8IZP0 508 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GNA15P30679 374 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SNF8Q96H20 258 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 H0Y3Z8 333 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GNGT2O14610 69 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 C21orf2O43822 256 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 PDXKO00764 312 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 CTDNEP1O95476 244 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 FAM167AQ96KS9 214 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 MTRQ99707 1265 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ATP8B3O60423 1300 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RHOBTB3O94955 611 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 MYBL1P10243 752 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GGPS1O95749 300 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ESRRGP62508 458 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 LRRC14Q15048 493 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TTLL6Q8N841 843 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ANKRD7Q92527 254 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 EYA4O95677 639 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 KRT14P02533 472 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GUCY1A3Q02108 690 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 KIF22Q14807 665 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 POLE2P56282 527 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GPS1Q13098 491 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 MS4A14Q96JA4 679 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 DRC3Q9H069 523 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 KRT80Q6KB66 452 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 USP49Q70CQ1 688 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 AGPAT1Q99943 283 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 MGEA5O60502 916 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 GPC3P51654 580 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 PSMC5P62195 406 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 SLC18A3Q16572 532 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 ICE2Q659A1 982 aa20.04■□□□□ 0.8
NOM1-201ENST00000275820 HIPK4Q8NE63 616 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms