RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261024.6

SLC40A1-201, Transcript of solute carrier family 40 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC40A1, Length 3,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1-201ENST00000261024 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 FAM196BA6NMK8 535 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MAPK13O15264 365 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 PFDN1O60925 122 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 KRT36O76013 467 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 RASSF2P50749 326 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 NAPAP54920 295 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 DBN1Q16643 649 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 RFX8Q6ZV50 586 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 ALG3Q92685 438 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 DYDC2Q96IM9 177 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 USP40Q9NVE5 1235 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 A0A1W2PRG0 241 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 COASYQ13057 564 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 CALCOCO2Q13137 446 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 PPP2R5EQ16537 467 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 KCNK18Q7Z418 384 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 FBXO41Q8TF61 875 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MAGEB18Q96M61 343 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 ZWILCHQ9H900 591 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 PARP2Q9UGN5 583 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.169e-8■■■□□ 15.5
SLC40A1-201ENST00000261024 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 ATP6V1G1O75348 118 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MARK3P27448 753 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 FOXN2P32314 431 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 DEUP1Q05D60 604 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 STRN3Q13033 797 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MFSD5Q6N075 450 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 CARD9Q9H257 536 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 MEGF6O75095 1541 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 TAC1P20366 129 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 NRG4Q8WWG1 115 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 USP20Q9Y2K6 914 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC40A1-201ENST00000261024 SPAG7O75391 227 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CDR2Q01850 454 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CMPK2Q5EBM0 449 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 TTC27Q6P3X3 843 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PNMA5Q96PV4 448 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 M0R2N6 131 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 NEK8Q86SG6 692 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CYP4X1Q8N118 509 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 TBCKQ8TEA7 893 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 INPP5DQ92835 1189 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PHF2O75151 1096 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 NR2F2P24468 414 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 IL9RQ01113 521 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CHRNA2Q15822 529 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 KYNUQ16719 465 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PNMA1Q8ND90 353 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PTPRN2Q92932 1015 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 STMN2Q93045 179 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 FAM163BP0C2L3 166 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 T-ENOLP0DO92 83 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CYP2D6P10635 497 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 CCNFP41002 786 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 ZNF365Q70YC5 407 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC40A1-201ENST00000261024 PRELID2Q8N945 189 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms