RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 GGPS1O95749 300 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 NPTX2P47972 431 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 KLK7P49862 253 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC26A2P50443 739 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 STAT5BP51692 787 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PEX3P56589 373 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ENPEPQ07075 957 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNH2Q12809 1159 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 IRF5Q13568 498 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 CST9Q5W186 159 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR59Q6PJI9 974 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EXOC8Q8IYI6 725 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM186BQ8IYM0 893 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 NEK11Q8NG66 645 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 SCFD2Q8WU76 684 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 BAP1Q92560 729 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TATDN2Q93075 761 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35C1Q96A29 364 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP89Q96ST8 783 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PTPN18Q99952 460 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 VTA1Q9NP79 307 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP72Q9P209 647 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXL5Q9UKA1 691 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EMSYQ7Z589 1322 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PMM2O15305 246 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC16A4O15374 487 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 NOL4O94818 638 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ARIH2O95376 493 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ADORA2AP29274 412 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MAPK4P31152 587 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL2P36404 184 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 CASP4P49662 377 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 SP4Q02446 784 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 GRB14Q14449 540 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TTLL4Q14679 1199 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM65Q6PJ69 517 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ARMCX2Q7L311 632 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MAEAQ7L5Y9 396 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 KSR1Q8IVT5 923 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 KIF18AQ8NI77 898 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 IFT74Q96LB3 600 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR20Q99678 358 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 AZI2Q9H6S1 392 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 NMRK2Q9NPI5 230 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO6Q9UM54 1294 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TBX20Q9UMR3 447 aa10.43□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ADGRA2Q96PE1 1338 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EPHB6O15197 1021 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 P4HA2O15460 535 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EXOC3O60645 756 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFA10O95299 355 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 NAMPTP43490 491 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 HUNKP57058 714 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT83P78385 493 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMC2Q13753 1193 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 MTF1Q14872 753 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EMC2Q15006 297 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 LY6KQ17RY6 165 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR78Q5VTH9 848 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PDXDC1Q6P996 788 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 GBP6Q6ZN66 633 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.42□□□□□ -0.74
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms