RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.94■■□□□ 1.42
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HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3CDO00329 1044 aa23.94■■□□□ 1.42
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HTATSF1-201ENST00000218364 MMP13P45452 471 aa23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.94■■□□□ 1.42
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HTATSF1-201ENST00000218364 DYDC2Q96IM9 177 aa23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 CD248Q9HCU0 757 aa23.92■■□□□ 1.42
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HTATSF1-201ENST00000218364 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.92■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX24Q9Y343 169 aa23.92■■□□□ 1.42
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 STRA6Q9BX79 667 aa23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 PARP2Q9UGN5 583 aa23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.9■■□□□ 1.42
HTATSF1-201ENST00000218364 GGPS1O95749 300 aa23.9■■□□□ 1.42
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