RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc12a9Q99MR3 914 aa14.21□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxo16Q9QZM9 334 aa14.21□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp408H7BX78 710 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd180Q62192 661 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AagabQ8R2R3 316 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tspan8Q8R3G9 235 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klhl20Q8VCK5 604 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700020D05RikQ99PB1 294 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 B4galt5Q9JMK0 388 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clca3bE9PUL3 1044 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 VegfaQ00731 214 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q3UK37 420 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Amer1Q7TS75 1132 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zbed4Q80WQ9 1168 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ddrgk1Q80WW9 315 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmco4Q91WU4 631 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Leng1Q9DB98 261 aa14.2□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp457L7N1X4 647 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GcP21614 476 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppp3caP63328 521 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fscn2Q32M02 492 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Taf3Q5HZG4 932 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fscn1Q61553 493 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mindy1Q76LS9 468 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MsraQ9D6Y7 233 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abcb6Q9DC29 842 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Usp29Q9ES63 869 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 A0A286YCQ6 122 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mmrn2A6H6E2 943 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Map2k1P31938 393 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Asap3Q5U464 904 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Erp44Q9D1Q6 406 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem206Q9D771 350 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Syt5Q9R0N5 386 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Svs3aF2Z472 265 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ByslO54825 436 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Calb1P12658 261 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Irf8P23611 424 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmod1P49813 359 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Actn4P57780 912 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PrkcbP68404 671 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GartQ64737 1010 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Upb1Q8VC97 393 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DgkhD3YXJ0 1156 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gimd1E9PW74 217 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Frat1P70339 274 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dpcr1Q3TNW5 500 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Icam5Q60625 917 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ints8Q80V86 995 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp64Q99KE8 643 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tp53P02340 387 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Chrna1P04756 457 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ZbbxQ0P5X5 716 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cyp11b1Q3TG86 501 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Frmd8Q3UFK8 466 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snx27Q3UHD6 539 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mcf2lQ64096 1149 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccpg1Q640L3 753 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Styk1Q6J9G1 429 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mapk15Q80Y86 549 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Elmo3Q8BYZ7 720 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Leg1Q8C6C9 337 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp623Q9CY99 499 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rsph3bQ9DA80 389 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf704Q9ERQ3 566 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fut2Q9JL27 347 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Robo3Q9Z2I4 1366 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tanc1Q0VGY8 1856 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm9857F7CXR1 130 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SprtnG3X912 497 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Guca2bO09051 106 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mcl1P97287 331 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PhkbQ7TSH2 1085 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prmt7Q922X9 692 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fthl17aQ9DAX0 182 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mettl1Q9Z120 268 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AfmO89020 608 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 EpoP07321 192 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Grm1P97772 1199 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pnpla5Q32LZ8 432 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Avpr1aQ62463 423 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Panx2Q6IMP4 677 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Creb3l3Q91XE9 479 aa14.17□□□□□ -0.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep72Q9D3R3 646 aa14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms