RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642102.1

CASC19-280, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,351 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-280	ENST00000642102	PTGS2	P35354	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ANTXR2	P58335	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RBL2	Q08999	1139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ACAP1	Q15027	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102		Q6ZPA2	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	XDH	P47989	1333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102		B4E1Z4	1266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	FOXN1	O15353	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KRT4	P19013	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ADRA1B	P35368	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KIF11	P52732	1056 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MKL1	Q969V6	931 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102		E9PSI1	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	CYP17A1	P05093	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	NME9	Q86XW9	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102		M0R2C6	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	DVL2	O14641	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PLD2	O14939	933 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KRT37	O76014	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RABGGTB	P53611	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	BCAR1	P56945	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	HAS1	Q92839	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MAFG	O15525	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	DAPK3	O43293	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MFAP3L	O75121	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TOX4	O94842	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	NUDT3	O95989	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	IGFALS	P35858	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	EPHA7	Q15375	998 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	KRT40	Q6A162	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	LENG9	Q96B70	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MNT	Q99583	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102		H7C1D1	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ZNF174	Q15697	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	GPR162	Q16538	588 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-280	ENST00000642102	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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