RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	KLRC1	P26715	233 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	MTAP	Q13126	283 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ESR2	Q92731	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	NEDD4	P46934	1319 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	TM4SF5	O14894	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	RFPL2	O75678	378 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	TDGF1	P13385	188 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	LIMK1	P53667	647 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	NRL	P54845	237 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	EVPL	Q92817	2033 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	FGF14	Q92915	247 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	NCAM2	O15394	837 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNK5	O95279	499 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAF1	Q13077	416 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	PARM1	Q6UWI2	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	PHKB	Q93100	1093 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	PIGS	Q96S52	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	PIDD1	Q9HB75	910 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPTAN1-231	ENST00000636337	BPTF	Q12830	3046 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	VTN	P04004	478 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	GALT	P07902	379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITGB5	P18084	799 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPINK2	P20155	84 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	STAT5B	P51692	787 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	FOXC1	Q12948	553 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	DPP7	Q9UHL4	492 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	LAMA5	O15230	3695 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	C2CD2L	O14523	706 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	LILRB3	O75022	631 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR32	O75388	356 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	GLUD1	P00367	558 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PFKP	Q01813	784 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	MTMR1	Q13613	665 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	NELL2	Q99435	816 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	GBP3	Q9H0R5	595 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	LAMA1	P25391	3075 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	CARNS1	A5YM72	827 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPTAN1-231	ENST00000636337	TEX28	O15482	410 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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