RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PQC6 194 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MYADML2A6NDP7 307 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CCNE1P24864 410 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 PLCB4Q15147 1175 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 P2RX5Q93086 422 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CEP170P1Q96L14 293 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 WDR24Q96S15 920 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 PADI6Q6TGC4 694 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MNS1Q8NEH6 495 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 SPC25Q9HBM1 224 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 BRCA2P51587 3418 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 H3BRB1 525 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 SLC26A2P50443 739 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MTERF2Q49AM1 385 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 GNASQ5JWF2 1037 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 POLD4Q9HCU8 107 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MYL3P08590 195 aa21.91■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.91■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.91■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 FAM167AQ96KS9 214 aa21.91■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 ADAMTS4O75173 837 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 STK4Q13043 487 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 GIT2Q14161 759 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 TRPC6Q9Y210 931 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 IDEP14735 1019 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 KRT9P35527 623 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 DNM2P50570 870 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 REEP2Q9BRK0 252 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN8-208ENST00000635751 NKX3-2P78367 333 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 UNC13DQ70J99 1090 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KAT2BQ92831 832 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KCND2Q9NZV8 630 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KIF5CO60282 957 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 HBP1O60381 514 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MSCO60682 206 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CHMP4BP1P59074 171 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MTFR1Q15390 333 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 LHX8Q68G74 356 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CARD6Q9BX69 1037 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.88■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TADA3O75528 432 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 F2P00734 622 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RSPH10BP0C881 870 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 UBXN4Q92575 508 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CEP89Q96ST8 783 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PANK4Q9NVE7 773 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SFI1A8K8P3 1242 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 GUCY2CP25092 1073 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms