RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614198.4

GGA3-221, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 3,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-221	ENST00000614198	CLIC2	O15247	247 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	GNGT1	P63211	74 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	AMPD3	Q01432	767 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	KCNB1	Q14721	858 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ANO5	Q75V66	913 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	DAW1	Q8N136	415 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	MMP19	Q99542	508 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	KCNJ18	B7U540	433 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ZEB2	O60315	1214 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	OSBP	P22059	807 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CASP14	P31944	242 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	KCNJ12	Q14500	433 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198		A0A0G2JMZ2	1700 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	N4BP3	O15049	544 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	FECH	P22830	423 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	P2RX5	Q93086	422 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198		B4DLN1	442 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	EYA4	O95677	639 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ATP4A	P20648	1035 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ADORA2A	P29274	412 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ACTR2	P61160	394 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CRYM	Q14894	314 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	EPHA7	Q15375	998 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	STXBP2	Q15833	593 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	RIT2	Q99578	217 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-221	ENST00000614198	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	HIP1R	O75146	1068 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PSMA7	O14818	248 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SRGAP2	O75044	1071 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GCNT3	O95395	438 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FDX1	P10109	184 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	BCR	P11274	1271 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CETP	P11597	493 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GTF2A2	P52657	109 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SMTN	P53814	917 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SKOR1	P84550	965 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CAP1	Q01518	475 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KCTD2	Q14681	263 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MYH11	P35749	1972 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MFAP3L	O75121	409 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	RARRES1	P49788	294 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KIAA1328	Q86T90	577 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KLC4	Q9NSK0	619 aa		10.83	□□□□□ -0.68

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