RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRPC6Q9Y210 931 aa9.91□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 N4BP3O15049 544 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CETN3O15182 167 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TGFB1I1O43294 461 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GNRH1P01148 92 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PTGS1P23219 599 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MARK3P27448 753 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CYP2C19P33261 490 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FLT3LGP49771 235 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CPT1AP50416 773 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRKCZQ05513 592 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NR1I3Q14994 352 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAN2A1Q16706 1144 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DGKDQ16760 1214 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMC6Q7Z403 805 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DRC7Q8IY82 874 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPC24Q8NBT2 197 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ACCSQ96QU6 501 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNF186Q9NXI6 227 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.9□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A1W2PQC6 194 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DENND3A2RUS2 1198 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC16A4O15374 487 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C22orf31O95567 290 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TBC1D8O95759 1140 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GLRA2P23416 452 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NKX3-2P78367 333 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KCNA1Q09470 495 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM14Q14142 442 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MIIPQ5JXC2 388 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IER5Q5VY09 327 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 POLD4Q9HCU8 107 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GABRQQ9UN88 632 aa9.89□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCDC169A6NNP5 214 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 H3BRB1 525 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAPK13O15264 365 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAGEB2O15479 319 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PIGRP01833 764 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HOXD10P28358 340 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DNM2P50570 870 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SOX10P56693 466 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CAP1Q01518 475 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPFIA1Q13136 1202 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CAPSQ13938 189 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RETREG2Q8NC44 543 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRPV1Q8NER1 839 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DEPTORQ8TB45 409 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM143Q96AN5 459 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ERO1AQ96HE7 468 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 VPS16Q9H269 839 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DMAC2Q9NW81 257 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SRRDQ9UH36 339 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TBX20Q9UMR3 447 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIP11Q15643 1979 aa9.88□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.87□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.87□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPR25O00155 361 aa9.87□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HAS3O00219 553 aa9.87□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SEPT4O43236 478 aa9.87□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TEX33O43247 280 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms