RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598938.1

LIG1-216, Transcript of DNA ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene LIG1, Length 377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1-216ENST00000598938 GPR32O75388 356 aa20.19■□□□□ 0.82
LIG1-216ENST00000598938 CXCL10P02778 98 aa20.19■□□□□ 0.82
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LIG1-216ENST00000598938 CYP11B2P19099 503 aa20.19■□□□□ 0.82
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LIG1-216ENST00000598938 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.19■□□□□ 0.82
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LIG1-216ENST00000598938 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.19■□□□□ 0.82
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LIG1-216ENST00000598938 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.17■□□□□ 0.82
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LIG1-216ENST00000598938 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 CUEDC2Q9H467 287 aa20.14■□□□□ 0.81
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LIG1-216ENST00000598938 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 A0A1B0GVL5 298 aa20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 ZBBXA8MT70 800 aa20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 HIP1RO75146 1068 aa20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 RABGGTBP53611 331 aa20.13■□□□□ 0.81
LIG1-216ENST00000598938 POU5F1BQ06416 359 aa20.13■□□□□ 0.81
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