RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 GHRP10912 638 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 BMP8BP34820 402 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CAPSQ13938 189 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TFDP1Q14186 410 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 RNF149Q8NC42 400 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ENGASEQ8NFI3 743 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 BSNDQ8WZ55 320 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 DDX12PQ92771 950 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 DRC1Q96MC2 740 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 NLRP4Q96MN2 994 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 NFKBIZQ9BYH8 718 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 C17orf75Q9HAS0 396 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 MAGEF1Q9HAY2 307 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SERTAD1Q9UHV2 236 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SFI1A8K8P3 1242 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF202O95125 648 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PTENP60484 403 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 AMPD3Q01432 767 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM240Q5SV17 173 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CNNM4Q6P4Q7 775 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 DBF4BQ8NFT6 615 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC19Q96DA6 116 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 REEP2Q9BRK0 252 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC27Q9C0I9 530 aa19.54■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 FGBP02675 491 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PLS3P13797 630 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 NAMPTP43490 491 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF131P52739 623 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PPP2R5AQ15172 486 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TCTN1Q2MV58 587 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF365Q70YC5 407 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SEPT8Q92599 483 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 STAMQ92783 540 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PAGE5Q96GU1 130 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 IFT74Q96LB3 600 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SCLT1Q96NL6 688 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 GBP4Q96PP9 640 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 C7orf25Q9BPX7 421 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PRO3102Q9H379 93 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ERVK-5Q9HDB9 667 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 KCNG1Q9UIX4 513 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 PADI3Q9ULW8 664 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TANC1Q9C0D5 1861 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CEP290O15078 2479 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 LTBP2Q14767 1821 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 GPR182O15218 404 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 RPS6KA5O75582 802 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CD52P31358 61 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 NPTX2P47972 431 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 UBE2HP62256 183 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 DYMQ7RTS9 669 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 FAM228AQ86W67 206 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 SPIRE2Q8WWL2 714 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 APBB2Q92870 758 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.721e-8■□□□□ 10.6
ZNF548-204ENST00000594693 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM9Q9C026 710 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 MINDY3Q9H8M7 445 aa19.52■□□□□ 0.72
ZNF548-204ENST00000594693 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 PHKA2P46019 1235 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 PEX3P56589 373 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 PAK2Q13177 524 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 ODR4Q5SWX8 454 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 KRBA2Q6ZNG9 492 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 HERVK_113Q902F9 699 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 TMX1Q9H3N1 280 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 PARVGQ9HBI0 331 aa19.51■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 FRMD3A2A2Y4 597 aa19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 FAM13AO94988 1023 aa19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 LIG1P18858 919 aa19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 IKBKEQ14164 716 aa19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 MYCT1Q8N699 235 aa19.5■□□□□ 0.71
ZNF548-204ENST00000594693 DEPTORQ8TB45 409 aa19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms