RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SEC14L1	Q92503	715 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	STRA6	Q9BX79	667 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CARD9	Q9H257	536 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM206	Q9H813	350 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R37	O75864	691 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B3	P37058	310 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	KIF22	Q14807	665 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	FAM151A	Q8WW52	585 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD62	A6NC57	917 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAB1	O14561	156 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	P4HA2	O15460	535 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PPAT	Q06203	517 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PDCL	Q13371	301 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	GPR88	Q9GZN0	384 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	VCPKMT	Q9H867	229 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	FEM1B	Q9UK73	627 aa		19.97	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	MYH11	P35749	1972 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	AR	P10275	920 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	BIRC3	Q13489	604 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TNIP1	Q15025	636 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	KSR1	Q8IVT5	923 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	AMACR	Q9UHK6	382 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	HIP1R	O75146	1068 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	FGG	P02679	453 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE6	P0CI01	402 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM49	P0CI25	452 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM49C	P0CI26	452 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ATP1A2	P50993	1020 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN2A	P68543	259 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRO	Q16827	1216 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	RAB17	Q9H0T7	212 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	EPN3	Q9H201	632 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	LSP1	P33241	339 aa		19.95	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	19.95	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		19.95	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA4	P13612	1032 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ABCB4	P21439	1286 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PLS1	Q14651	629 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PADI6	Q6TGC4	694 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	LDHD	Q86WU2	507 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PFAS	O15067	1338 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559		H0YGN5	161 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559		K7ENM7	598 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PTEN	P60484	403 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK7	Q13164	816 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MSL1	Q68DK7	614 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	AGPAT1	Q99943	283 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	NFS1	Q9Y697	457 aa		19.94	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TTI1	O43156	1089 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DAPK3	O43293	454 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PPIP5K2	O43314	1243 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D12	O60347	775 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ERLIN2	O94905	339 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TCEAL1	Q15170	157 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DAW1	Q8N136	415 aa		19.93	■□□□□ 0.78

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