RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 ODR4Q5SWX8 454 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF149Q8NC42 400 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA20Q8TB22 786 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 FIZ1Q96SL8 496 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 GINS2Q9Y248 185 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIP14410 1827 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC169A6NNP5 214 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHRNA1P02708 482 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAP43P17677 238 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 EHHADHQ08426 723 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 MGAT3Q09327 533 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLRP7Q8WX94 980 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMARCE1Q969G3 411 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBX21Q9UL17 535 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMC2O95347 1197 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAMPTP43490 491 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBL2Q08999 1139 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP2R5AQ15172 486 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAGE1Q8TC20 777 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 OSMRQ99650 979 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 EXOC1Q9NV70 894 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC16A4O15374 487 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 BFSP2Q13515 415 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TFDP1Q14186 410 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF410Q86VK4 478 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCLT1Q96NL6 688 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSDMAQ96QA5 445 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 HIPK3Q9H422 1215 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 M0QZ92 97 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAND2O75155 1236 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 RHOBTB3O94955 611 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCKAP1LP55160 1127 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTENP60484 403 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDC42EP1Q00587 391 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNB1Q14721 858 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM26DQ5JW98 314 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 ISM2Q6H9L7 571 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEPTORQ8TB45 409 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 K7ENM7 598 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 BIN1O00499 593 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 PITPNM1O00562 1244 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SELPP16109 830 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP2C18P33260 490 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASP5P51878 434 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMTNP53814 917 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 POU5F1BQ06416 359 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK4Q13043 487 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-203ENST00000559737 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms