RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552620.1

CHMP4A-210, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 716 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-210ENST00000552620 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 FSCN2O14926 492 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 KLRC4O43908 158 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 NDUFA10O95299 355 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 SRGNP10124 158 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 AMPD1P23109 780 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 CCNE1P24864 410 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 CASP1P29466 404 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 BAG6P46379 1132 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 POU4F3Q15319 338 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 MEA1Q16626 185 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 MAP9Q49MG5 647 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 WDR93Q6P2C0 686 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF384Q8TF68 577 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 STAMQ92783 540 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 DNAJC7Q99615 494 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 ST7Q9NRC1 585 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT82Q9NSB4 513 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 BARHL2Q9NY43 387 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PPT2Q9UMR5 302 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.65□□□□□ -1.34
CHMP4A-210ENST00000552620 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 PHLPP1O60346 1717 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 A0A1W2PQJ5 194 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TTC26A0AVF1 554 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 SMIM22K7EJ46 135 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 STXBP3O00186 592 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 OIP5O43482 229 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT86O43790 486 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TSPY3P0CV98 308 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TSPY8P0CW00 308 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 GNA11P29992 359 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ETFBP38117 255 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ZBED6P86452 979 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 AMPD2Q01433 879 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 IQCEQ6IPM2 695 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TTI2Q6NXR4 508 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 GK5Q6ZS86 529 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 CABP7Q86V35 215 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 RUBCNQ92622 972 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 EPC1Q9H2F5 836 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 C6orf50Q9HD87 102 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 MED4Q9NPJ6 270 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 EXOC1Q9NV70 894 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 NARFQ9UHQ1 456 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 GDAQ9Y2T3 454 aa6.64□□□□□ -1.35
CHMP4A-210ENST00000552620 ABCB11O95342 1321 aa6.64□□□□□ -1.35
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