RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 ERMNQ8TAM6 284 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 NLRP4Q96MN2 994 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 MTRQ99707 1265 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 AAASQ9NRG9 546 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 NCOR1O75376 2440 aa20.57■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 SKIP12755 728 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 STK24Q9Y6E0 443 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 LAD1O00515 517 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.55■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 FERMT3Q86UX7 667 aa20.55■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM143Q96AN5 459 aa20.55■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 TECP42680 631 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 GATMP50440 423 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 RAB27AP51159 221 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.54■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 NACC1Q96RE7 527 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 RAB34Q9BZG1 259 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.54■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 FGFR1P11362 822 aa20.53■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 LAG3P18627 525 aa20.53■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.53■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.53■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.53■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 H3BQV1 296 aa20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF623O75123 536 aa20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PRPHP41219 470 aa20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 COL19A1Q14993 1142 aa20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TSPAN4-216ENST00000526055 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.52■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 MED24O75448 989 aa20.51■□□□□ 0.87
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TSPAN4-216ENST00000526055 ARL2P36404 184 aa20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 PTENP60484 403 aa20.51■□□□□ 0.87
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TSPAN4-216ENST00000526055 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 ARID2Q68CP9 1835 aa20.5■□□□□ 0.87
TSPAN4-216ENST00000526055 BMP1P13497 986 aa20.5■□□□□ 0.87
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