RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523939.1

ALKAL1-202, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 536 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-202ENST00000523939 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.42■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 TMX1Q9H3N1 280 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 POLD4Q9HCU8 107 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 HIP1RO75146 1068 aa21.41■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 BAIAP3O94812 1187 aa21.41■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF131P52739 623 aa21.41■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.41■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 KCNN1Q92952 543 aa21.41■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CUEDC2Q9H467 287 aa21.41■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.4■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 DSC3Q14574 896 aa21.4■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 TDHQ8IZJ6 230 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 IQUBQ8NA54 791 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 RNF149Q8NC42 400 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 NLRP7Q8WX94 980 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 SEPT8Q92599 483 aa21.4■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 NLRP4Q96MN2 994 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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ALKAL1-202ENST00000523939 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 GINS2Q9Y248 185 aa21.4■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 MYMKA6NI61 221 aa21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 RPS6KA5O75582 802 aa21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 NAMPTP43490 491 aa21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 AMHR2Q16671 573 aa21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 SV2BQ7L1I2 683 aa21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.39■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.39■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.38■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.37■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 SFI1A8K8P3 1242 aa21.37■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 ENPP3O14638 875 aa21.37■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 ACTN1P12814 892 aa21.37■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 TFDP1Q14186 410 aa21.37■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.37■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 SLFN14P0C7P3 912 aa21.36■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 PLS3P13797 630 aa21.36■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 FGFR4P22455 802 aa21.36■■□□□ 1.01
ALKAL1-202ENST00000523939 PHKA2P46019 1235 aa21.36■■□□□ 1.01
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ALKAL1-202ENST00000523939 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.36■■□□□ 1.01
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