RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	NOX5	Q96PH1	765 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	FBXO40	Q9UH90	709 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SNX12	Q9UMY4	172 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SRGAP2	O75044	1071 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ICAM3	P32942	547 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	STXBP2	Q15833	593 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	GJB7	Q6PEY0	223 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	KIFAP3	Q92845	792 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	BTBD7	Q9P203	1132 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CEP170P1	Q96L14	293 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PRLR	P16471	622 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	FER	P16591	822 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	NPTX2	P47972	431 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SMTN	P53814	917 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	NAB2	Q15742	525 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	RDH13	Q8NBN7	331 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	MMS19	Q96T76	1030 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	RAB21	Q9UL25	225 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP8B3	O60423	1300 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	STAT1	P42224	750 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PRKCE	Q02156	737 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CNTN2	Q02246	1040 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PPAT	Q06203	517 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	STK33	Q9BYT3	514 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	TBX20	Q9UMR3	447 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	NENF	Q9UMX5	172 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011		F8VZ95	297 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	VAMP7	P51809	220 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	BRD3	Q15059	726 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ELP3	Q9H9T3	547 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC151	A5D8V7	595 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC169	A6NNP5	214 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	DGAT1	O75907	488 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	RTP1	P59025	263 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SP4	Q02446	784 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	BSND	Q8WZ55	320 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PDE4D-223	ENST00000515011	IRF6	O14896	467 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	P4HA2	O15460	535 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	RFX1	P22670	979 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	KLRC1	P26715	233 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SOX5	P35711	763 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SP2	Q02086	613 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ERO1B	Q86YB8	467 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	LMO3	Q8TAP4	145 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	BUB1	O43683	1085 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PEX10	O60683	326 aa		24.88	■■□□□ 1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms