RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF410Q86VK4 478 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 HELQQ8TDG4 1101 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM20AQ96MK3 541 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MBOAT7Q96N66 472 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CARNS1A5YM72 827 aa21.61■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 TECP42680 631 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 EDAQ92838 391 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 AIFM3Q96NN9 605 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF19AQ9NV58 838 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.6■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 NEK8Q86SG6 692 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 WASF1Q92558 559 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNH6Q9H252 994 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM150BA6NC51 233 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.59■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 STBD1O95210 358 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 SCRN1Q12765 414 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM169Q96HH4 297 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP4Q96MN2 994 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.59■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ANO5Q75V66 913 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.58■■□□□ 1.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 CEP170P1Q96L14 293 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PPME1Q9Y570 386 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR81Q562E7 1941 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 HIDE1A8MVS5 230 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TBX3O15119 743 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC37A4O43826 429 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB27AP51159 221 aa21.57■■□□□ 1.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP89Q96ST8 783 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 STK36Q9NRP7 1315 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 EML1O00423 815 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL14O95715 111 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CES5AQ6NT32 575 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KSR1Q8IVT5 923 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SUSD6Q92537 303 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 APOL5Q9BWW9 433 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PFKFB2O60825 505 aa21.55■■□□□ 1.04
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