RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 KCND2Q9NZV8 630 aa20.21■□□□□ 0.83
C1orf109-212ENST00000498448 INSL6Q9Y581 213 aa20.21■□□□□ 0.83
C1orf109-212ENST00000498448 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RABGGTBP53611 331 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 IFT74Q96LB3 600 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PLIN2Q99541 437 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ADAM2Q99965 735 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 TMX1Q9H3N1 280 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DACT1Q9NYF0 836 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.2■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PLA2G4BP0C869 781 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 GLRA2P23416 452 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PBX2P40425 430 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PTENP60484 403 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 KCNK18Q7Z418 384 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 TET1Q8NFU7 2136 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 EPSTI1Q96J88 318 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CLIC6Q96NY7 704 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.19■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CUTAO60888 179 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 UPP2O95045 317 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PLCG1P19174 1290 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 KRT85P78386 507 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CAPSQ13938 189 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DSC3Q14574 896 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DRC1Q96MC2 740 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 YME1L1Q96TA2 773 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 EVPLQ92817 2033 aa20.18■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ERLIN2O94905 339 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SKIP12755 728 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 FGFR4P22455 802 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 GUCY2CP25092 1073 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 NAMPTP43490 491 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SPECC1Q5M775 1068 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 STK17AQ9UEE5 414 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 C9IYK1 514 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 MGEA5O60502 916 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 AXLP30530 894 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DDIT3P35638 169 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ME1P48163 572 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SLC12A3P55017 1021 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 FAM189BP81408 668 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DEFB123Q8N688 67 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 DEPTORQ8TB45 409 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RAD54LQ92698 747 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF576Q9H609 170 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 SIP14410 1827 aa20.16■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 HIP1RO75146 1068 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 CA3P07451 260 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 MYOGP15173 224 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 USP49Q70CQ1 688 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
C1orf109-212ENST00000498448 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms