RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491053.5

USP20-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 590 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-206ENST00000491053 KIFAP3Q92845 792 aa18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 TIFAQ96CG3 184 aa18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 TIPINQ9BVW5 301 aa18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 KCND2Q9NZV8 630 aa18.27■□□□□ 0.52
USP20-206ENST00000491053 DENND3A2RUS2 1198 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 TLL1O43897 1013 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 GLRA2P23416 452 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PBX2P40425 430 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PTENP60484 403 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 KCNK18Q7Z418 384 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RAD9AQ99638 391 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CHST12Q9NRB3 414 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RGS18Q9NS28 235 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 INSL6Q9Y581 213 aa18.26■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 STAG3L1P0CL83 205 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RABGGTBP53611 331 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CAPSQ13938 189 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 DSC3Q14574 896 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PPP2R5AQ15172 486 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ADAM2Q99965 735 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 DACT1Q9NYF0 836 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 MGEA5O60502 916 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PLA2G4BP0C869 781 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PLCG1P19174 1290 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 GUCY2CP25092 1073 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SLC12A3P55017 1021 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 NUCB2P80303 420 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RINT1Q6NUQ1 792 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 EPSTI1Q96J88 318 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 DRC1Q96MC2 740 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CLIC6Q96NY7 704 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 STK17AQ9UEE5 414 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CDH23Q9H251 3354 aa18.24■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 C9IYK1 514 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CUTAO60888 179 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 NAMPTP43490 491 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 KRT85P78386 507 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RAD54LQ92698 747 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 IFT74Q96LB3 600 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PLIN2Q99541 437 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ERLIN2O94905 339 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 UPP2O95045 317 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CA3P07451 260 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 MYOGP15173 224 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FGFR4P22455 802 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 AXLP30530 894 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 DDIT3P35638 169 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FAM189BP81408 668 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 SPECC1Q5M775 1068 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.22■□□□□ 0.51
USP20-206ENST00000491053 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms