RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	LXN	Q9BS40	222 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM6	O15303	877 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF623	O75123	536 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SLITRK3	O94933	977 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	LAG3	P18627	525 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB27A	P51159	221 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP170P1	Q96L14	293 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SCLT1	Q96NL6	688 aa		19.3	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB1	P05556	798 aa		19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MUT	P22033	750 aa		19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCB3	Q01970	1234 aa		19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		19.29	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WZ62	844 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PPM1A	P35813	382 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	DRP2	Q13474	957 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMK1	Q14012	370 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MCTP1	Q6DN14	999 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CASD1	Q96PB1	797 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		19.28	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC3A	Q02505	3323 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM205C	A6NFA0	338 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	DGAT1	O75907	488 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NPEPPS	P55786	919 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ABI1	Q8IZP0	508 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC43	Q8N309	656 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	DYDC2	Q96IM9	177 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CWH43	Q9H720	699 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	RGL1	Q9NZL6	768 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	STK24	Q9Y6E0	443 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		19.27	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNA5	P22460	613 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	AXL	P30530	894 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PHKA2	P46019	1235 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	BECN1	Q14457	450 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	XKR9	Q5GH70	373 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TPH2	Q8IWU9	490 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	POF1B	Q8WVV4	589 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF19A	Q9NV58	838 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	STK39	Q9UEW8	545 aa		19.26	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM150B	A6NC51	233 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TXK	P42681	527 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	HYAL1	Q12794	435 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM15	Q13444	863 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	EMC2	Q15006	297 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FERMT3	Q86UX7	667 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CNNM3	Q8NE01	707 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PGBD4	Q96DM1	585 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	MTR	Q99707	1265 aa		19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF18	O76093	207 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFR1	P11362	822 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	GATM	P50440	423 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT17	Q04695	432 aa		19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TFDP1	Q14186	410 aa		19.24	■□□□□ 0.67

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