RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 WRNIP1Q96S55 665 aa4.58□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.58□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.58□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 GSTA4O15217 222 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 GPR39O43194 453 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 GAS7O60861 476 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MMEP08473 750 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 FBLP22087 321 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PROZP22891 400 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MC4RP32245 332 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ADRA1BP35368 520 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 LSSP48449 732 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 KIF11P52732 1056 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 IGBP1P78318 339 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TBR1Q16650 682 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 USP7Q93009 1102 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 FAM89AQ96GI7 184 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 KATNBL1Q9H079 304 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 IFT22Q9H7X7 185 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZMAT4Q9H898 229 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.57□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PRKD3O94806 890 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 FBXO21O94952 628 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 IL18BPO95998 194 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MTMR1Q13613 665 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 VASNQ6EMK4 673 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TTC1Q99614 292 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 KCND1Q9NSA2 647 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.56□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 H7C1D1 291 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 RAB11FIP3O75154 756 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MPIG6BO95866 241 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 FAHP16930 419 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ANAPC15P60006 121 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SLC25A3Q00325 362 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 CHRNA2Q15822 529 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 BROXQ5VW32 411 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 EFHBQ8N7U6 833 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ASB15Q8WXK1 588 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TOMM22Q9NS69 142 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 BTBD7Q9P203 1132 aa4.55□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 APPP05067 770 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 GUCY2FP51841 1108 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 C21orf58P58505 322 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 RBM10P98175 930 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TERF2Q15554 542 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 CD276Q5ZPR3 534 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SLC5A5Q92911 643 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 PRRX2Q99811 253 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MCM8Q9UJA3 840 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.54□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 FOXP2O15409 715 aa4.53□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 ZEB2O60315 1214 aa4.53□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 MAFKO60675 156 aa4.53□□□□□ -1.68
SENP6-208ENST00000483859 AOAHP28039 575 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms