RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP2R5C	Q13362	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM160B2	Q86V87	743 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM58	Q8NG06	486 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC35C1	Q96A29	364 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HACL1	Q9UJ83	578 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDXK	O00764	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAP2K7	O14733	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TLR10	Q9BXR5	811 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PALM	O75781	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTGER2	P43116	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNIP1	Q15025	636 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ASIC2	Q16515	512 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPAG5	Q96R06	1193 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GCNT4	Q9P109	453 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SORBS3	O60504	671 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPP2	Q13103	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PARVG	Q9HBI0	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EPHA7	Q15375	998 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IQCD	Q96DY2	449 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SIX2	Q9NPC8	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ETAA1	Q9NY74	926 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ECEL1	O95672	775 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ICAM1	P05362	532 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDCL	Q13371	301 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DAW1	Q8N136	415 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VPS33B	Q9H267	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HIP1R	O75146	1068 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAP3K10	Q02779	954 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRAF1	Q13077	416 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRKG1	Q13976	671 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CBWD6	Q4V339	395 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SAAL1	Q96ER3	474 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYH11	P35749	1972 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PJA2	O43164	708 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATP9A	O75110	1047 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLSTN1	O94985	981 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VCAM1	P19320	739 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNFAIP1	Q13829	316 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UGCG	Q16739	394 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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