RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480371.1

TTC23-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 23, human

TSL 5

Gene TTC23, Length 776 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC23-208	ENST00000480371	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	RPA1	P27694	616 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PRPH	P41219	470 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PHKA2	P46019	1235 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	POU5F1B	Q06416	359 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	DSC3	Q14574	896 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	EMC2	Q15006	297 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	P2RX5	Q93086	422 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371		A0A0U1RQF3	1178 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	POTEM	A6NI47	508 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	NCK2	O43639	380 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MGEA5	O60502	916 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	LPXN	O60711	386 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	RAB27A	P51159	221 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PTGDR	Q13258	359 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	DRP2	Q13474	957 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TMEM143	Q96AN5	459 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	DLL1	O00548	723 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	WNT7A	O00755	349 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ERLIN2	O94905	339 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	AXL	P30530	894 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	RARRES1	P49788	294 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	RNF149	Q8NC42	400 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	HLA-C	Q95604	372 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PGBD4	Q96DM1	585 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ZBTB39	O15060	712 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	F13A1	P00488	732 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	LAG3	P18627	525 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	REST	Q13127	1097 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	KSR1	Q8IVT5	923 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	SLC26A4	O43511	780 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	ZNF623	O75123	536 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	MED24	O75448	989 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTC23-208	ENST00000480371	BRD1	O95696	1058 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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