RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 USP8P40818 1118 aa6.56□□□□□ -1.36
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SHQ1-205ENST00000468371 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 XKR3Q5GH77 459 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KRT40Q6A162 431 aa6.56□□□□□ -1.36
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SHQ1-205ENST00000468371 CDC27P30260 824 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PAFAH1B1P43034 410 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.54□□□□□ -1.36
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