RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466715.5

CERKL-210, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 4

Gene CERKL, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-210ENST00000466715 SSH2Q76I76 1423 aa7.4□□□□□ -1.22
CERKL-210ENST00000466715 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ALS2Q96Q42 1657 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ACOT7O00154 380 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 GABRDO14764 452 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ERVK-21P61565 698 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 LRRC32Q14392 662 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 OR14I1A6ND48 311 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 POLD1P28340 1107 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 FNTBP49356 437 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 EPHB1P54762 984 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 HERVK_113P62684 666 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 GRIN1Q05586 938 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 INAVAQ3KP66 663 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 C16orf92Q96LL3 132 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZMAT4Q9H898 229 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ATP7BP35670 1465 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ABLIM1O14639 778 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 FBXO21O94952 628 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 GLI1P08151 1106 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 FAHP16930 419 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PDE6BP35913 854 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 NEK2P51955 445 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 RGL3Q3MIN7 710 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 CLTCL1P53675 1640 aa7.37□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 IFT172Q9UG01 1749 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TNKSO95271 1327 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 RASSF10A6NK89 507 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 FOXP2O15409 715 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PAPLNO95428 1278 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 CD40P25942 277 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 MCL1Q07820 350 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 EPHA7Q15375 998 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 MIB1Q86YT6 1006 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PAPPAQ13219 1627 aa7.36□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 LRRC37A3O60309 1634 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 HRKO00198 91 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 LRG1P02750 347 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ADCY1Q08828 1119 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 NME9Q86XW9 330 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 DTLQ9NZJ0 730 aa7.35□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 NUP155O75694 1391 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 MMEP08473 750 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 KCNMB1Q16558 191 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ASB15Q8WXK1 588 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 GBP4Q96PP9 640 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.34□□□□□ -1.23
CERKL-210ENST00000466715 ASB1Q9Y576 335 aa7.34□□□□□ -1.23
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