RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ANK1P16157 1881 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ANO9A1A5B4 782 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIF5CO60282 957 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SERPING1P05155 500 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 UCHL3P15374 230 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A1P19634 815 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ADSSP30520 456 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CASQ1P31415 396 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GJA5P36382 358 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIF11P52732 1056 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CNTN2Q02246 1040 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ENPEPQ07075 957 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R5AQ15172 486 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ELF2Q15723 593 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ODR4Q5SWX8 454 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RRAGAQ7L523 313 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ERO1BQ86YB8 467 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KSR1Q8IVT5 923 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MYCT1Q8N699 235 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 CDHR1Q96JP9 859 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PCYT2Q99447 389 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CARD6Q9BX69 1037 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MGAMO43451 1857 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 UNCXA6NJT0 531 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TISP43B9A030 160 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CLIC2O15247 247 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PEX10O60683 326 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PIGRP01833 764 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 CYP27A1Q02318 531 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC18A3Q16572 532 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 IQCEQ6IPM2 695 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.18□□□□□ -1.42
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