RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 DRP2Q13474 957 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 IQUBQ8NA54 791 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 CUEDC2Q9H467 287 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 SCN5AQ14524 2016 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR32O75388 356 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTN1P12814 892 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL2P36404 184 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE4CQ08493 712 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 MCM6Q14566 821 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PDILTQ8N807 584 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ARID2Q68CP9 1835 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087X0B3 334 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBBXA8MT70 800 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 CXCL10P02778 98 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GUCY2CP25092 1073 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GPC3P51654 580 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRE1Q14246 886 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 SV2BQ7L1I2 683 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF410Q86VK4 478 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC15Q8TF66 581 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 KIFAP3Q92845 792 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 SCLT1Q96NL6 688 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 NBNO60934 754 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 RABGGTBP53611 331 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 TFDP1Q14186 410 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 MBTPS1Q14703 1052 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GPNMBQ14956 572 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 KIZQ2M2Z5 673 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ODR4Q5SWX8 454 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GPBP1Q86WP2 473 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 NLRP7Q8WX94 980 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX58Q96C10 678 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GINS2Q9Y248 185 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GVL5 298 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PFKFB1P16118 471 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 POU5F1BQ06416 359 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 E2F4Q16254 413 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 FSIP1Q8NA03 581 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 DRC1Q96MC2 740 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC9A7Q96T83 725 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 OSMRQ99650 979 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 USP25Q9UHP3 1055 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 HPSEQ9Y251 543 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 HIP1RO75146 1068 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GHRP10912 638 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 GLRA2P23416 452 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 AMPD3Q01432 767 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LPIN1Q14693 890 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP2R5AQ15172 486 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ARSHQ5FYA8 562 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 SEPT8Q92599 483 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT74Q96LB3 600 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 NLRP4Q96MN2 994 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms