RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439168.1

AC005588.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005588.1, Length 162 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005588.1-201ENST00000439168 RPS6KA5O75582 802 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ACRP10323 421 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DARSP14868 501 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PFKFB1P16118 471 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 GLRA2P23416 452 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 EPHB4P54760 987 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 AMPD3Q01432 767 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CAPSQ13938 189 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 IKBKEQ14164 716 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 E2F4Q16254 413 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF365Q70YC5 407 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 MAEAQ7L5Y9 396 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 KSR1Q8IVT5 923 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 FSIP1Q8NA03 581 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 RNF149Q8NC42 400 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 HERVK_113Q902F9 699 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DHX58Q96C10 678 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 VWCEQ96DN2 955 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PANK2Q9BZ23 570 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 TNMDQ9H2S6 317 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PRO3102Q9H379 93 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 HPSEQ9Y251 543 aa10.06□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 A0A1B0GVL5 298 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 LRRIQ4A6NIV6 560 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 TBCAO75347 108 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SLFN14P0C7P3 912 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SCP2P22307 547 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CD52P31358 61 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SYKP43405 635 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 NAMPTP43490 491 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 EFNA5P52803 228 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PTENP60484 403 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 MAPK7Q13164 816 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ARSHQ5FYA8 562 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 TDHQ8IZJ6 230 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 REEP2Q9BRK0 252 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 KBTBD4Q9NVX7 518 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PADI3Q9ULW8 664 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.05□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 MYMKA6NI61 221 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 H0YCG3 227 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 FAM13AO94988 1023 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PLS3P13797 630 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 NDUFA8P51970 172 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF131P52739 623 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SMTNP53814 917 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 GIT2Q14161 759 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SHHQ15465 462 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 RASIP1Q5U651 963 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CATSPER4Q7RTX7 472 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 FAM228AQ86W67 206 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DAW1Q8N136 415 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DEPTORQ8TB45 409 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 BSNDQ8WZ55 320 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 DDX12PQ92771 950 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 GBP4Q96PP9 640 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 PARVGQ9HBI0 331 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.04□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.03□□□□□ -0.8
AC005588.1-201ENST00000439168 CCDC169A6NNP5 214 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms