RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 PSMC5P62195 406 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 DRP2Q13474 957 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 NPY5RQ15761 445 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TMC7Q7Z402 723 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CEP89Q96ST8 783 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 SKIP12755 728 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 XBP1P17861 261 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 PBX3P40426 434 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 INF2Q27J81 1249 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 LETM2Q2VYF4 491 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 ZNF410Q86VK4 478 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 HELQQ8TDG4 1101 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 SUSD6Q92537 303 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 AIFM3Q96NN9 605 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 A0A087WZ62 844 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TMEM150BA6NC51 233 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TECP42680 631 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 KCNC3Q14003 757 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 FAM20AQ96MK3 541 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TRIOO75962 3097 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CARNS1A5YM72 827 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 HIDE1A8MVS5 230 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PHKA2P46019 1235 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 ANO5Q75V66 913 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 SLC37A4O43826 429 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PPP2R5CQ13362 524 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 NEK8Q86SG6 692 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CASP10Q92851 521 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TMEM169Q96HH4 297 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TECTAO75443 2155 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 MARCH6O60337 910 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 RAB27AP51159 221 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 BCAR1P56945 870 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 SCRN1Q12765 414 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 NLRP4Q96MN2 994 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 S1PR5Q9H228 398 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PPME1Q9Y570 386 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 STK36Q9NRP7 1315 aa22.74■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 EML1O00423 815 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 ZXDAP98168 799 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 VAV3Q9UKW4 847 aa22.73■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TMEM221A6NGB7 291 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 M0R296 226 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TBX3O15119 743 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 ZNF623O75123 536 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CA8P35219 290 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 KSR1Q8IVT5 923 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PGBD4Q96DM1 585 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CEP170P1Q96L14 293 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms