RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC188H7C350 402 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP2AO43633 222 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM13AO94988 1023 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCB4P21439 1286 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 COG2Q14746 738 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP1-202ENST00000417536 CYP2J2P51589 502 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 ODF2Q5BJF6 829 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 DYDC2Q96IM9 177 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 STK24Q9Y6E0 443 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM49CP0CI26 452 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 GAP43P17677 238 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 FMO5P49326 533 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP1-202ENST00000417536 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP1-202ENST00000417536 BMP3P12645 472 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 TMOD1P28289 359 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 COPB2P35606 906 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 NPEPPSP55786 919 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 UBXN2AP68543 259 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP1-202ENST00000417536 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 SLITRK3O94933 977 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 RFFLQ8WZ73 363 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.24■□□□□ 0.83
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