RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PODXLO00592 558 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 GRAPQ13588 217 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DOK7Q18PE1 504 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PDIK1LQ8N165 341 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 KAZALD1Q96I82 304 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ECT2Q9H8V3 914 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINB2P05120 415 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 MXI1P50539 228 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PMS2P54278 862 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SURF1Q15526 300 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 RFX8Q6ZV50 586 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD1Q719H9 257 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DIAPH2O60879 1101 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 EPHB1P54762 984 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 POTEBQ6S5H4 581 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DUX4Q9UBX2 424 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 CDHR1Q96JP9 859 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ITSN1Q15811 1721 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.892e-6■■□□□ 13.4
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PTPRM-202ENST00000400053 UBE2SQ16763 222 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 IRAK1P51617 712 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SEC24CP53992 1094 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.46□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP36Q96G28 342 aa9.46□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 SNX25Q9H3E2 840 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.46□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 HAUS5O94927 633 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CCNYQ8ND76 341 aa9.46□□□□□ -0.89
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